Геномные и биологические характеристики сифовируса из сельскохозяйственной почвы

Сотрудники лаборатории генетики и селекции микроорганизмов ФГБНУ ВНИИСХМ под руководством Румянцевой М.Л. опубликовали в журнале Data статью, по изучению геномных и биологических характеристик умеренного фага Sinorhizobium, AP-202, выделенного из сельскохозяйственного чернозема. Ключевая особенность генома фага — экстремально низкое содержание GC нуклеотидов (всего 27%) при длине в 121 599 т.п.н., что отличает его от большинства известных фагов. Фаг имеет сифовирусную морфологию и Т7-подобный механизм упаковки ДНК. Анализ доменной структуры белков, кодируемых генами «темной материи», позволил предположить, что AP-202 может выполнять роль «экологического фильтра» в почвенных микробных сообществах, избирательно подавляя численность бактерий-хозяев.

По совокупности геномных и функциональных особенностей фаг отнесен к новой филогенетической линии и представляет собой уникальную модель для изучения коэволюции фагов и ризобий в почвенных экосистемах.

Исследование выполнено в рамках проекта РНФ 24-26-00274.

Roumiantseva M.L., Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Saksaganskaia, A.S., Gorshkov, A.N., Kabilov, M.R., Simarov, B.V.; Whole-Genome Sequencing of Sinorhizobium Phage AP-202, a Novel Siphovirus from Agricultural Soil. Data. 2026 Jan 11(1):15 https://doi.org/10.3390/data11010015